Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.73□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YPT6YLR262C 648 nt-0.73□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YPR039WYPR039W 336 nt-0.73□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YOL029CYOL029C 606 nt-0.74□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YHR138CYHR138C 345 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 APQ13YJL075C 417 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 MRPS8YMR158W 468 nt-0.75□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.76□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 POP7YBR167C 423 nt-0.76□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YPL182CYPL182C 384 nt-0.77□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YBR099CYBR099C 384 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 PCF11YDR228C 1881 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 GRX5YPL059W 453 nt-0.78□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 YER135CYER135C 393 nt-0.8□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 RPF1YHR088W 888 nt-0.8□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 SDH7YDR511W 402 nt-0.8□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YHL041WYHL041W 450 nt-0.8□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 snR36snR36 182 nt-0.8□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.81□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.81□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 HMRA2YCR096C 360 nt-0.81□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.81□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.82□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.82□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YDL011CYDL011C 324 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YNL058CYNL058C 951 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YCR001WYCR001W 315 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 SGF11YPL047W 300 nt-0.83□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YGL230CYGL230C 444 nt-0.84□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YGR025WYGR025W 303 nt-0.84□□□□□ -2.54
TY1B-BLQ12490 YLR334CYLR334C 381 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 YCR100CYCR100C 951 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.85□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 RPS25BYLR333C 327 nt-0.86□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 snR9snR9 187 nt-0.87□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 snR161snR161 161 nt-0.87□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 EST1YLR233C 2100 nt-0.87□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 YLR282CYLR282C 342 nt-0.88□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 YBL062WYBL062W 381 nt-0.88□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 YPR092WYPR092W 306 nt-0.88□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 COG6YNL041C 2520 nt-0.89□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 SNU13YEL026W 381 nt-0.9□□□□□ -2.55
TY1B-BLQ12490 AGA2YGL032C 264 nt-0.91□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 FYV7YLR068W 456 nt-0.91□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.92□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YLR041WYLR041W 321 nt-0.93□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 BLI1YKL061W 342 nt-0.94□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.95□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YDR366CYDR366C 399 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YKL044WYKL044W 321 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YMR254CYMR254C 309 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YBL071CYBL071C 309 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YNL303WYNL303W 348 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YDR426CYDR426C 378 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 MND1YGL183C 660 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 ZEO1YOL109W 342 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YPL068CYPL068C 882 nt-0.96□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 SCEIQ0160 708 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.97□□□□□ -2.56
TY1B-BLQ12490 YER079WYER079W 633 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.98□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 AIM29YKR074W 468 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.99□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YPL229WYPL229W 621 nt-1□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 CMC1YKL137W 336 nt-1.01□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YKL083WYKL083W 615 nt-1.03□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YAR029WYAR029W 225 nt-1.03□□□□□ -2.57
TY1B-BLQ12490 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.06□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 YHR130CYHR130C 336 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 YOR015WYOR015W 360 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 YIL029CYIL029C 429 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-BLQ12490 YJR087WYJR087W 351 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YLR456WYLR456W 615 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YDL016CYDL016C 303 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YFL012WYFL012W 447 nt-1.16□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.16□□□□□ -2.59
TY1B-BLQ12490 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.18□□□□□ -2.6
TY1B-BLQ12490 YGL182CYGL182C 324 nt-1.18□□□□□ -2.6
TY1B-BLQ12490 YFL063WYFL063W 456 nt-1.19□□□□□ -2.6
TY1B-BLQ12490 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.2□□□□□ -2.6
TY1B-BLQ12490 YJL182CYJL182C 318 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-BLQ12490 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-BLQ12490 CBS1YDL069C 690 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-BLQ12490 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.23□□□□□ -2.61
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