Protein–RNA interactions for Protein: Q03919

RUB1, NEDD8-like protein RUB1, yeastyeast

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUB1Q03919 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.74□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YBR099CYBR099C 384 nt-0.74□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 snR33snR33 183 nt-0.74□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 RPM2YML091C 3609 nt-0.74□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YLR282CYLR282C 342 nt-0.75□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 MND1YGL183C 660 nt-0.76□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.76□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt-0.76□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.76□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.77□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.77□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YPL182CYPL182C 384 nt-0.77□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YJR087WYJR087W 351 nt-0.78□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.78□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.78□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 RPF1YHR088W 888 nt-0.79□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YHR138CYHR138C 345 nt-0.79□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.79□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YKL083WYKL083W 615 nt-0.79□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.79□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 SVS1YPL163C 783 nt-0.79□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 BLI1YKL061W 342 nt-0.8□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YCR100CYCR100C 951 nt-0.81□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 SNU13YEL026W 381 nt-0.81□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.81□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.82□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YKL044WYKL044W 321 nt-0.82□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 ISF1YMR081C 1017 nt-0.82□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YLR334CYLR334C 381 nt-0.83□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.83□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 ZEO1YOL109W 342 nt-0.83□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.83□□□□□ -2.54
RUB1Q03919 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 HMRA2YCR096C 360 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YDR426CYDR426C 378 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YER079WYER079W 633 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YIL029CYIL029C 429 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YPL068CYPL068C 882 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.86□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.87□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YLR269CYLR269C 351 nt-0.87□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 RPS25BYLR333C 327 nt-0.87□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YBL071CYBL071C 309 nt-0.87□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 snR161snR161 161 nt-0.87□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YDL011CYDL011C 324 nt-0.88□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YJL120WYJL120W 324 nt-0.89□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YLR041WYLR041W 321 nt-0.89□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YDR366CYDR366C 399 nt-0.9□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YER175W-AYER175W-A 165 nt-0.9□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 FYV7YLR068W 456 nt-0.9□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.9□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YPL229WYPL229W 621 nt-0.9□□□□□ -2.55
RUB1Q03919 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.91□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.91□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 GLG1YKR058W 1851 nt-0.91□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-0.92□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 MRPS8YMR158W 468 nt-0.92□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.94□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 URB1YKL014C 5295 nt-0.95□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.95□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YHR130CYHR130C 336 nt-0.95□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.95□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.96□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YNL303WYNL303W 348 nt-0.96□□□□□ -2.56
RUB1Q03919 YDL016CYDL016C 303 nt-0.98□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 GRX5YPL059W 453 nt-0.98□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 COG6YNL041C 2520 nt-0.98□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 HUG1YML058W-A 207 nt-0.99□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 snR36snR36 182 nt-0.99□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YFL012WYFL012W 447 nt-1□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 AGA2YGL032C 264 nt-1.01□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.01□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 GPI15YNL038W 690 nt-1.01□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.02□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 AIM29YKR074W 468 nt-1.02□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YDR544CYDR544C 429 nt-1.03□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.03□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.03□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.03□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YAR047CYAR047C 321 nt-1.03□□□□□ -2.57
RUB1Q03919 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.04□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 STF2YGR008C 255 nt-1.04□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.05□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 PRM3YPL192C 402 nt-1.06□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.07□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.08□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YJL182CYJL182C 318 nt-1.08□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YAR029WYAR029W 225 nt-1.08□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-1.08□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 CBS1YDL069C 690 nt-1.09□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 QCR9YGR183C 201 nt-1.09□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YLR456WYLR456W 615 nt-1.09□□□□□ -2.58
RUB1Q03919 YAL066WYAL066W 309 nt-1.1□□□□□ -2.59
RUB1Q03919 YOR170WYOR170W 306 nt-1.1□□□□□ -2.59
RUB1Q03919 snR49snR49 165 nt-1.1□□□□□ -2.59
RUB1Q03919 YFL063WYFL063W 456 nt-1.12□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.9 ms