Protein–RNA interactions for Protein: P53225

YGR039W, Uncharacterized protein YGR039W, yeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR039W	P53225	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	YDL016C	YDL016C	303 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	QCR9	YGR183C	201 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	YAL066W	YAL066W	309 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	YLR101C	YLR101C	396 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	YHL041W	YHL041W	450 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	TAR1	YLR154W-C	375 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	HTB2	YBL002W	396 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
YGR039W	P53225	YDL011C	YDL011C	324 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	snR46	snR46	197 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YPL225W	YPL225W	441 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	PRP39	YML046W	1890 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	ECL1	YGR146C	636 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YJL007C	YJL007C	315 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YOR032W-A	YOR032W-A	201 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YPL229W	YPL229W	621 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YPR092W	YPR092W	306 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	HMRA2	YCR096C	360 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	YBL071C	YBL071C	309 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	DIE2	YGR227W	1578 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YGR039W	P53225	ZEO1	YOL109W	342 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	FYV7	YLR068W	456 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YLR269C	YLR269C	351 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	MPC1	YGL080W	393 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	GRX5	YPL059W	453 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YGR039W	P53225	YKL083W	YKL083W	615 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YLR282C	YLR282C	342 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	PCF11	YDR228C	1881 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YLR334C	YLR334C	381 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YJL120W	YJL120W	324 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	RPS25B	YLR333C	327 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YDR426C	YDR426C	378 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YNL303W	YNL303W	348 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YGR039W	P53225	YPL068C	YPL068C	882 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	YHR138C	YHR138C	345 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	GPI15	YNL038W	690 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	SNU13	YEL026W	381 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	BLI1	YKL061W	342 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	YBR072C-A	YBR072C-A	162 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	EST1	YLR233C	2100 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
YGR039W	P53225	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YDR354C-A	YDR354C-A	144 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	ISF1	YMR081C	1017 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YOR161W-A	YOR161W-A	81 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	PCC1	YKR095W-A	267 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YLR041W	YLR041W	321 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YAR047C	YAR047C	321 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YHR125W	YHR125W	306 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	YLR456W	YLR456W	615 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YGR039W	P53225	UTP8	YGR128C	2142 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YDR366C	YDR366C	399 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	CBS1	YDL069C	690 nt		-1	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YER084W-A	YER084W-A	513 nt		-1	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	RPM2	YML091C	3609 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	Q0255	Q0255	1419 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YGL123C-A	YGL123C-A	231 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YGR039W	P53225	AIM29	YKR074W	468 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	AGA2	YGL032C	264 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	snR33	snR33	183 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	YKL100W-A	YKL100W-A	90 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	GLG1	YKR058W	1851 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	YFL012W	YFL012W	447 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	YAR029W	YAR029W	225 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YGR039W	P53225	EAF6	YJR082C	342 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
YGR039W	P53225	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YGR039W	P53225	YHR130C	YHR130C	336 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YGR039W	P53225	snR36	snR36	182 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
YGR039W	P53225	PRM3	YPL192C	402 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YGR039W	P53225	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YGR039W	P53225	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
YGR039W	P53225	SDH6	YDR379C-A	240 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
YGR039W	P53225	snR54	snR54	86 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
YGR039W	P53225	YFL063W	YFL063W	456 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
YGR039W	P53225	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YGR039W	P53225	VPS20	YMR077C	666 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YGR039W	P53225	BI2	Q0110	1272 nt		-1.22	□□□□□ -2.6

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