Protein–RNA interactions for Protein: P53049

YOR1, Oligomycin resistance ATP-dependent permease YOR1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR1P53049 YCR001WYCR001W 315 nt-0.54□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.54□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YEL073CYEL073C 324 nt-0.55□□□□□ -2.5
YOR1P53049 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.55□□□□□ -2.5
YOR1P53049 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.57□□□□□ -2.5
YOR1P53049 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.57□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YDL011CYDL011C 324 nt-0.57□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YNL058CYNL058C 951 nt-0.57□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YDL016CYDL016C 303 nt-0.58□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.58□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YAL066WYAL066W 309 nt-0.58□□□□□ -2.5
YOR1P53049 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.61□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.61□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.61□□□□□ -2.51
YOR1P53049 BER1YLR412W 825 nt-0.61□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YCR100CYCR100C 951 nt-0.62□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YNL319WYNL319W 441 nt-0.62□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.63□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.64□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-0.65□□□□□ -2.51
YOR1P53049 RPM2YML091C 3609 nt-0.66□□□□□ -2.51
YOR1P53049 HMRA2YCR096C 360 nt-0.66□□□□□ -2.51
YOR1P53049 YCR022CYCR022C 345 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOR1P53049 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOR1P53049 HTB2YBL002W 396 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YPL229WYPL229W 621 nt-0.67□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.68□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YHL041WYHL041W 450 nt-0.68□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YLR101CYLR101C 396 nt-0.69□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YBL071CYBL071C 309 nt-0.69□□□□□ -2.52
YOR1P53049 DIE2YGR227W 1578 nt-0.69□□□□□ -2.52
YOR1P53049 FYV7YLR068W 456 nt-0.7□□□□□ -2.52
YOR1P53049 ZEO1YOL109W 342 nt-0.72□□□□□ -2.52
YOR1P53049 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.72□□□□□ -2.52
YOR1P53049 MPC1YGL080W 393 nt-0.73□□□□□ -2.53
YOR1P53049 SGF11YPL047W 300 nt-0.73□□□□□ -2.53
YOR1P53049 ECL1YGR146C 636 nt-0.73□□□□□ -2.53
YOR1P53049 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.78□□□□□ -2.53
YOR1P53049 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.79□□□□□ -2.54
YOR1P53049 YLR334CYLR334C 381 nt-0.79□□□□□ -2.54
YOR1P53049 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YOR1P53049 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YOR1P53049 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
YOR1P53049 YLR282CYLR282C 342 nt-0.8□□□□□ -2.54
YOR1P53049 YNL303WYNL303W 348 nt-0.82□□□□□ -2.54
YOR1P53049 GRX5YPL059W 453 nt-0.82□□□□□ -2.54
YOR1P53049 RPS25BYLR333C 327 nt-0.83□□□□□ -2.54
YOR1P53049 YJL120WYJL120W 324 nt-0.84□□□□□ -2.54
YOR1P53049 YPL205CYPL205C 345 nt-0.84□□□□□ -2.54
YOR1P53049 YDR426CYDR426C 378 nt-0.85□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-0.85□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-0.85□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YPR092WYPR092W 306 nt-0.85□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YBR099CYBR099C 384 nt-0.87□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YLR269CYLR269C 351 nt-0.88□□□□□ -2.55
YOR1P53049 PCF11YDR228C 1881 nt-0.89□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YHR138CYHR138C 345 nt-0.89□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YKL083WYKL083W 615 nt-0.89□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YPL068CYPL068C 882 nt-0.89□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YLR041WYLR041W 321 nt-0.9□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-0.91□□□□□ -2.55
YOR1P53049 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.92□□□□□ -2.56
YOR1P53049 SNU13YEL026W 381 nt-0.92□□□□□ -2.56
YOR1P53049 YLR456WYLR456W 615 nt-0.93□□□□□ -2.56
YOR1P53049 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.93□□□□□ -2.56
YOR1P53049 GPI15YNL038W 690 nt-0.93□□□□□ -2.56
YOR1P53049 BLI1YKL061W 342 nt-0.96□□□□□ -2.56
YOR1P53049 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.96□□□□□ -2.56
YOR1P53049 COG6YNL041C 2520 nt-0.96□□□□□ -2.56
YOR1P53049 EST1YLR233C 2100 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YDR366CYDR366C 399 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR1P53049 Q0255Q0255 1419 nt-0.98□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YAR029WYAR029W 225 nt-0.99□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.99□□□□□ -2.57
YOR1P53049 snR33snR33 183 nt-0.99□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YAR047CYAR047C 321 nt-1□□□□□ -2.57
YOR1P53049 snR161snR161 161 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOR1P53049 snR36snR36 182 nt-1.01□□□□□ -2.57
YOR1P53049 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.02□□□□□ -2.57
YOR1P53049 AGA2YGL032C 264 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YHR125WYHR125W 306 nt-1.04□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.05□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.07□□□□□ -2.58
YOR1P53049 CBS1YDL069C 690 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YFL012WYFL012W 447 nt-1.08□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.09□□□□□ -2.58
YOR1P53049 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR1P53049 EAF6YJR082C 342 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR1P53049 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR1P53049 snR54snR54 86 nt-1.1□□□□□ -2.59
YOR1P53049 YHR130CYHR130C 336 nt-1.11□□□□□ -2.59
YOR1P53049 AIM29YKR074W 468 nt-1.12□□□□□ -2.59
YOR1P53049 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.14□□□□□ -2.59
YOR1P53049 VPS20YMR077C 666 nt-1.15□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms