Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnga1P29974 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms