Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RhoP15409 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RhoP15409 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RhoP15409 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RhoP15409 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RhoP15409 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RhoP15409 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms