Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

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Length 920 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmafO35242 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmafO35242 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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NsmafO35242 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NsmafO35242 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms