Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700019A02RikA0A087WPV9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms