Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpv2Q9WTR1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms