Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc1Q9QZF2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gpc1Q9QZF2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gpc1Q9QZF2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gpc1Q9QZF2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpc1Q9QZF2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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