Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Card11Q8CIS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Card11Q8CIS0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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