Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc30Q8BVF4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc30Q8BVF4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms