Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms