Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc92bQ5SUE3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92bQ5SUE3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms