Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mdc1Q5PSV9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms