Protein–RNA interactions for Protein: Q03919

RUB1, NEDD8-like protein RUB1, yeastyeast

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUB1Q03919 YEL073CYEL073C 324 nt-0.48□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.48□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 DIE2YGR227W 1578 nt-0.49□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 SEC10YLR166C 2616 nt-0.49□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 NIP100YPL174C 2607 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 PAA1YDR071C 576 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YGL015CYGL015C 393 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YOL160WYOL160W 342 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 SPO21YOL091W 1830 nt-0.5□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YER135CYER135C 393 nt-0.51□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 PRP39YML046W 1890 nt-0.51□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YBL062WYBL062W 381 nt-0.51□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YNL319WYNL319W 441 nt-0.51□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.52□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YOL029CYOL029C 606 nt-0.52□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.53□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.53□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 ILM1YJR118C 612 nt-0.53□□□□□ -2.49
RUB1Q03919 YGR164WYGR164W 336 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 ANS1YHR126C 480 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YLR217WYLR217W 324 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 HTB2YBL002W 396 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YOL014WYOL014W 375 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YPL185WYPL185W 396 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 UBS1YBR165W 834 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 snR46snR46 197 nt-0.54□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 SPO13YHR014W 876 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YMR254CYMR254C 309 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 PBI2YNL015W 228 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 SGF11YPL047W 300 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YPR039WYPR039W 336 nt-0.55□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 ECL1YGR146C 636 nt-0.56□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YGR228WYGR228W 345 nt-0.56□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YPR092WYPR092W 306 nt-0.56□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 snR51snR51 107 nt-0.56□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 HAL9YOL089C 3093 nt-0.56□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YGL239CYGL239C 315 nt-0.57□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 CMC1YKL137W 336 nt-0.57□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YPL205CYPL205C 345 nt-0.57□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YCR001WYCR001W 315 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 BUD26YDR241W 288 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 PCF11YDR228C 1881 nt-0.58□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 MRPL32YCR003W 552 nt-0.59□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.59□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YDR133CYDR133C 336 nt-0.59□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.59□□□□□ -2.5
RUB1Q03919 BUL2YML111W 2763 nt-0.6□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 SDH7YDR511W 402 nt-0.6□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.6□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.6□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 HUR1YGL168W 333 nt-0.61□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.61□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YPL261CYPL261C 309 nt-0.61□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.62□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 IPP1YBR011C 864 nt-0.62□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 SLX9YGR081C 633 nt-0.63□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YPT6YLR262C 648 nt-0.63□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 CSE1YGL238W 2883 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YHL041WYHL041W 450 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YIR044CYIR044C 186 nt-0.64□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 BER1YLR412W 825 nt-0.65□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 YPL225WYPL225W 441 nt-0.65□□□□□ -2.51
RUB1Q03919 UTP8YGR128C 2142 nt-0.66□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YKL202WYKL202W 582 nt-0.66□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 RPS30BYOR182C 192 nt-0.66□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YBR063CYBR063C 1215 nt-0.66□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 PTP2YOR208W 2253 nt-0.66□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.67□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 snR9snR9 187 nt-0.68□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YGR025WYGR025W 303 nt-0.68□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YGR115CYGR115C 780 nt-0.68□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 ATG31YDR022C 591 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 TIM13YGR181W 318 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 SCEIQ0160 708 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 APQ13YJL075C 417 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YNL058CYNL058C 951 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 POP7YBR167C 423 nt-0.69□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 EST1YLR233C 2100 nt-0.7□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YCR022CYCR022C 345 nt-0.71□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 RPS20YHL015W 366 nt-0.72□□□□□ -2.52
RUB1Q03919 YGL230CYGL230C 444 nt-0.73□□□□□ -2.53
RUB1Q03919 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
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