Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epb41P48193 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms