Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa10P31310 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa10P31310 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms