Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga1P29974 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms