Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna3O08545 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna3O08545 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna3O08545 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms