Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PnckQ9QYK9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PnckQ9QYK9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms