Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdcl3Q8BVF2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pdcl3Q8BVF2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms