Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik4Q8BMF5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik4Q8BMF5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms