Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot1Q6ZQ08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot1Q6ZQ08 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms