Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn13Q64512 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ptpn13Q64512 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ptpn13Q64512 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn13Q64512 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ptpn13Q64512 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn13Q64512 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn13Q64512 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn13Q64512 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ptpn13Q64512 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ptpn13Q64512 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn13Q64512 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Ptpn13Q64512 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn13Q64512 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn13Q64512 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn13Q64512 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms