Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms