Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms