Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epb41P48193 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epb41P48193 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms