Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga1P29974 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga1P29974 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms