Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bbip1J3QMK2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms