Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms