Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd4A2AKM2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd4A2AKM2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms