Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933424G06RikA0A140LIP3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933424G06RikA0A140LIP3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.6 ms