Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3glb1Q9JK48 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3glb1Q9JK48 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms