Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms