Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gps1Q99LD4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms