Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc30Q8BVF4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc30Q8BVF4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms