Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brf2Q3UAW9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brf2Q3UAW9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms