Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f6O54917 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f6O54917 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms