Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bbip1J3QMK2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bbip1J3QMK2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms