Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
6030445D17RikE9Q8F9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
6030445D17RikE9Q8F9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms