Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm13E9PZZ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm13E9PZZ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms