Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc8E9PWG2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc8E9PWG2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms