Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brpf1B2RRD7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms