Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700019A02RikA0A087WPV9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700019A02RikA0A087WPV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms