Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hmgn5Q9JL35 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hmgn5Q9JL35 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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