Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx6Q9ER75 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx6Q9ER75 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms