Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms