Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtpbp4Q99ME9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms