Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gps1Q99LD4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gps1Q99LD4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms